Под управлением АО «Коми холдинг» объединены компании, осуществляющие деятельность в различных секторах экономики – дорожного хозяйства, добычи общераспространенных полезных ископаемых, социально-значимых перевозок водным транспортом в Печорском бассейне, научно-исследовательской деятельности в области разведки и добычи углеводородов. Всего в структуре АО «Коми холдинг» насчитывается 8 компаний.